“分子”基金于2012年由化学与分子工程学院2012届毕业生自愿捐赠发起设立，基金用于奖励和资助品学兼优的学生、为学院学生工作做出突出贡献的优秀学生等方面。 “分子基金”恰如其名，极具化学院特色，是化学院学子发扬“感恩母校、奉献爱心”精神的集中体现，五年间已帮助很多有困难的同学渡过难关。积薄而为厚，聚少而为多。正是这种如分子力一般强大的感召力，鼓舞着同学们把对母校的爱、师长的爱、同学的爱通过“分子基金”一届一届、心手相传的传承下去，也促使着“分子基金”项目不断发展壮大、越做越好，切实发挥了资助困难同学、助力学院发展的作用。